Le budget de fonctionnement annuel du SÉUO est adopté par le conseil d'administration au plus tard le 1er août. Le budget annuel doit tenir compte de toutes les recettes et dépenses projetées pour l'exercice en cours, y compris les budgets de la vie étudiante et des événements, les budgets de services, le financement du club, le régime de soins de santé et de soins dentaires, les frais votés par référendum et toute subvention ou fonds de réserve.

Le budget de fonctionnement est rédigé par le président et le commissaire aux opérations en coordination avec le Comité des finances et la direction du SÉUO. Une fois adopté, le budget de fonctionnement peut être modifié par le Comité exécutif (jusqu'à 5 %) ou le Comité des finances (jusqu'à 10 %).

À la fin de chaque mandat, le commissaire aux opérations sortant préparera également un budget préliminaire, qui sera approuvé par le conseil d'administration sortant en avril.

Une vérification externe des finances du SÉUO doit être effectuée chaque année, au plus tard le 30 septembre. Le conseil d'administration approuve les comptes vérifiés en octobre. Ils sont présentés aux membres généraux chaque année à l'Assemblée générale d'automne.